Ο απώτερος στόχος μιας τέτοιας ενέργειας είναι να προσδιοριστεί και να τεκμηριωθεί μέσω μιας ιστοπαθολογικής έκθεσης η υφιστάμενη παθολογική κατάσταση - νόσημα.
Σε περιπτώσεις μικρού μεγέθους βλαβών ή όπου δεν τίθεται υπόνοια κακοήθειας η βιοψία περιλαμβάνει ολόκληρη την έκταση της παθολογικής περιοχής προσλαμβάνοντας ταυτόχρονα και θεραπευτικό χαρακτήρα (ολική βιοψία – βιοψία εξαίρεση). Στις υπόλοιπες περιπτώσεις αφαιρείται μόνο ένα μικρό κομμάτι της προσβληθείσας περιοχής για να επιβεβαιωθεί η διάγνωση (μερική βιοψία). Η βιοψία δεν εφαρμόζεται σε όλες τις παθολογικές καταστάσεις προκειμένου να τεθεί η διάγνωση, αποτελεί όμως ένα ισχυρό διαγνωστικό εργαλείο στα χέρια ενός έμπειρου ιατρού, εφαρμόζοντας το στις περιπτώσεις όπου ο ίδιος κρίνει σκόπιμο.
Αναφορικά με την χειρουργική πρακτική, η ενδοστοματική βιοψία πραγματοποιείται σε χώρο ιατρείου, χωρίς να απαιτείται στην πλειονότητα των περιπτώσεων περιβάλλον νοσοκομείου. Αρχικά γίνεται στην περιοχή ενδιαφέροντος τοπική αναισθησία, και αφού εξασφαλισθεί ικανοποιητικό βάθος αναλγησίας γίνεται εκτομή με νυστέρι του τμήματος ιστών όπως έχει ήδη σχεδιασθεί εκ των προτέρων από τον επεμβαίνοντα. Έπειτα συνήθως τοποθετούνται κάποια ράμματα προκειμένου να συγκλεισθεί το τραύμα, τα οποία αφαιρούνται περίπου σε 10 ημέρες. Η όλη διαδικασία (τοπική αναισθητική ένεση, βιοψία και ραφή) διαρκεί συνολικά 5 – 10 λεπτά. Μετεγχειρητικά θα δοθούν οδηγίες που πρέπει να ακολουθήσετε πιστά για να ολοκληρωθεί η επούλωση του τραύματος με τον ταχύτερο και ασφαλέστερο τρόπο.